一、行政机构

学院党政办公室、教学办公室、学生工作办公室、研究生办公室、科研办公室

二、教学机构

农学系、植物保护系、园艺系、农业资源与环境系

三、研究机构

亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室（水稻、甘蔗、木薯、果树、作物养分高效利用方向）、亚热带农业生物资源保护与利用国际科技合作基地、蔗糖产业省部共建协同创新中心、农业部农药登记田间药效试验单位、农业部农药残留试验资质认证单位；广西亚热带果蔬国际科技合作基地、广西甘蔗生物学重点实验室/重大科技创新基地、广西农业环境与农产品安全重点实验室、广西（水稻、木薯、蔬菜、食用菌）良种培育中心、广西芒果产业技术创新战略联盟、广西蔬菜产业技术创新战略联盟、广西蔗糖产业协同创新中心、广西甘蔗生物学重点实验室；广西高校植物遗传育种重点实验室、广西高校作物栽培学与耕作学重点实验室、广西高校农业环境与农产品质量安全重点实验室；我校水稻研究所、我校甘蔗研究所、我校园艺研究所、应用昆虫研究所、我校蚕学研究所、我校农药与环境毒理研究所、我校食用菌研究所、我校转基因植物产品检测中心。我校生态与旅游科学研究院、我校软科学研究所、我校中草药资源与中药农业研究所、我校农科实验实习协同创新基地、我校生态经济与游憩管理研究中心、我校都市农业研究中心、bat365在线平台分析测试研究中心。

4、教辅机构

植物科学试验教学示范中心（下设本科实验室、大型仪器平台、校内农科基地）、 自治区级虚拟仿真实验教学中心。